高校生の響裕太がグリッドマンと一体化し、クラスメイトの内海将や宝多六花と共に怪獣の脅威に立ち向かう。しかし、人々の怪獣の記憶が消されるという驚くべき事態に直面する。裕太たちはグリッドマンと共に、ツツジ台に隠された秘密と怪獣を操る者の目的に迫っていく。本作品は特撮アニメ「SSSS.GRIDMAN」の劇場総集編となっている。
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蝉の声が聞こえる中で繰り広げられる日常の風景。そんなツツジ台の静寂は、怪獣の声によって破られた。響裕太は内なる声に呼ばれ、ハイパーエージェント・グリッドマンと一体化する。グリッドマンとなった裕太は苦戦しながらも倒すことができた。
裕太のクラスメートの内海将、宝多六花はグリッドマンの誕生に立ち会ったことで、３人はグリッドマン同盟を結成する。しかし、３人は翌日驚くべき現実に直面した。人々から怪獣の記憶が消され、犠牲になった人々はそもそも存在しないことになっていたのだ。
裕太たちはグリッドマンとともに、この世界に迫りくる危機に向かっていくことを決意する。ツツジ台に隠された秘密とは？ そして怪獣を操る者の目的は？
