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マッドサイエンティスト「カイン」は、 肉体と精神を支配する宇宙物質【オビディオンス】 を発見し、全世界へとばら撒いた。
オビディオンスを投与された人々は洗脳され、 カインに服従することになった。
カインは、洗脳した人々を集め、 帝国「プレセン」を設立。 全世界に宣戦布告した彼は、圧倒的な破壊と 虐殺で、人々に服従を迫った。時を同じくして、オビディオンスの洗脳を解除する力を持つ者が各地で現れ始めた。
いつしか、彼らはリベレーションと呼ばれ、 彼らの「KISS」があれば、洗脳を解除することができた。
対帝国組織「Ｒ.Ｅ.Ａ.Ｐ.（リーフ）」は 帝国の機甲師団に対抗すべく、リベレーションを 長とした機甲部隊「Goddess Kiss」を編成。 「Goddess Kiss」に配備された少女たちは、 兵器を駆り、激しい戦いに身を投じる。 帝国を倒し、再び平和を取り戻すその日まで。